PE 藻红蛋白荧光有两种：B-PE和R-PE。具体结构在此不多讲。

R-PE和B-PE是具有最强荧光的藻胆蛋白，量子效率超过90％。二者相比，B-PE的荧光更强。但在应用上，一般常用R-PE, 这是因为R-PE在 488nm 左右的激发光谱中有一个“峰”(见以下光谱图），这使得它更适合与大多数 FCM 和微阵列读取器的激光一起使用。它广泛与 FITC 串联使用，一起用于三重或四重检测。

因此如果没有特别说明，可以认为PE就是指R-PE。

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