Bangslabs的BioMag Plus ConA 磁珠是CUT&RUN实验中的经典试剂。CUT&RUN技术最早由Skene等人[1]在2017年公开。目前已为很多科研人员采用。
BioMag Plus ConA磁珠(Concanavalin A-coated magnetic beads)在CUT&RUN(Cleavage Under Targets and Release Using Nuclease)平台上的应用,主要是通过其特异性结合糖蛋白的能力来富集或固定某些靶细胞或蛋白复合物,从而优化实验流程。其具体应用场景和优势:
1. 细胞固定与分离
原理:ConA(刀豆蛋白A)是一种凝集素,可特异性结合细胞表面的糖蛋白(如α-甘露糖、α-葡萄糖残基),尤其适用于真核细胞(如哺乳动物细胞、酵母)的固定。
应用:
细胞预固定:在CUT&RUN中,ConA磁珠可先将细胞锚定在磁珠表面,便于后续抗体和MNase的渗透处理,减少细胞损失(特别适用于悬浮细胞,如淋巴细胞、K562等)。
去除非靶细胞:若样本中存在混合细胞群(如免疫细胞亚群),ConA磁珠可选择性结合特定细胞类型,提高靶细胞纯度。
2. 替代传统固相载体
优势:相比琼脂糖珠或普通磁珠,ConA磁珠的糖蛋白结合特性可减少非特异性吸附,降低背景噪音。
操作简化:细胞与ConA磁珠结合后,可直接在磁力架上进行洗涤和试剂更换,无需离心步骤,避免细胞损伤。
3. 特殊样本处理
酵母/真菌细胞:ConA可高效结合酵母细胞壁的甘露聚糖,适用于真菌染色质研究的CUT&RUN(如研究转录因子在酵母基因组中的结合位点)。
原代细胞:对难以转染或脆弱的原代细胞(如神经元、免疫细胞),ConA磁珠提供温和的固定方式。
[1] Skene, P., Henikoff, J. & Henikoff, S. Targeted in situ genome-wide profiling with high efficiency for low cell numbers. Nat Protoc 13, 1006–1019 (2018). https://doi.org/10.1038/nprot.2018.015
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