Ribo-tRNA 分析
2025-08-29
2025-08-29
Immagina Biotechnology 公司新推出Ribo-tRNA技术,该技术整合了Immagina公司的RiboLace seq及nano tRNAseq 技术平台,能对结合在活性核糖体上,参与翻译状态下tRNA进行全长测序,揭示其丰度及修饰。整个实验仅需要3-4天。
RiboLace方法的核心在于一种名为3P的专利嘌呤霉素衍生物。它能与活性核糖体相互作用,并通过其与磁珠结合,高效的富集分离活性核糖体,相关的技术见Cell Report in 2018。
tRNA存在广泛的转录后修饰且在翻译过程中处于变化状态,对其研究具有比较困难。依赖cDNA和PCR测序等传统方法往往难以捕捉tRNA的这种复杂性。nano-tRNAseq是唯一能够对tRNA进行全长、天然状态测序的技术,可同步评估tRNA丰度与修饰状态,详见 Nature Biotech in 2024。
Ribo-tRNA 的流程如下:先用RiboLace将活性核糖体富集,然后再纯化上面小分子RNA(1),经过脱酰基化处理(2)后,tRNA与适配体结合并随后连接条形码(3),随后在牛津纳米孔技术(ONT)平台上对天然tRNA进行测序(4)。当tRNA穿过纳米孔时,每个碱基会产生电流信号,这些信号被转化为tRNA序列。经过数据分析(5)后,即可获得tRNA丰度、以及转录后化学修饰的信息。
至此,Immagina公司围绕核糖体翻译组开发了如下的技术及试剂盒:
图2 Immagina技术平台及其应用
汉诺除了提供以上试剂盒外,也提供nano tRNA测序服务。
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